下記コマンドをDSM上のタスクスケジューラへ登録することで、手動でのNTPによる時刻取得が実行可能です。
[コントロールパネル]>[タスクスケジューラ]を起動し、
1) 作成ボタン>予約タスク>ユーザー指定のスクリプト
2) 全般タブのユーザー名はrootとし、任意のタスク名を入力
3) スケジュールタブで、実行スケジュールを指定
4) タスク設定タブのユーザー指定のスクリプト欄へ、以下を入力
ntpdate -u [NTPサーバ名]
例)
ntpdate -u time1.google.com
5) OKボタンで閉じる。